Cem Gürdeniz, Deniz Harp Okulu Uluslararası İlişkiler Bölümü'nden 1979 yılında mezun oldu. Deniz Kuvvetleri Komutanı Özel Sekreterliği (1998-2001), Deniz Kuvvetleri Plan Prensipler Başkanlığı Antlaşmalar Şube Müdürlüğü (2001-2002), Harp Filosu III. Muhrip Filotillası Komodorluğu (2002-2003) Deniz Kuvvetleri Plan Prensipler Başkanlığı Strateji Daire Başkanlığı (2003- 2005), Deniz Kuvvetleri Plan Prensipler Başkanlığı (2005-2007) görevlerini yürüttü. Daha sonra Çıkarma Gemileri Komutanlığı’na, 2008 yılında Tümamiralliğe terfi ederek Mayın Filosu Komutanlığı’na getirilmiştir. 2009-2011 yılları arasında tekrar Deniz Kuvvetleri Plan Prensipler Başkanlığı görevini yürütmüş, 11 Şubat 2011 tarihinde sözde Balyoz Davası’nda sahte delillerle tutuklanmış, 18 yıl hüküm giymiş, Anayasa Mahkemesi’nin 19 Haziran 2014 tarihindeki yeniden yargılama kararıyla özgürlüğüne kavuşmuş, 9 Haziran 2015 tarihinde beraat etmiştir. İngilizce ve Fransızca bilen Gürdeniz Deniz Kuvvetleri Dergisi’nde 1979-2005 arasında yirmi iki makale yayımlamıştır ve Türk Deniz Kuvvetleri El Kitabı 2000, İngilizce/Türkçe ve Türkçe/ İngilizce Deniz Terimleri Sözlüğü, Cumhuriyet Donanması (Prestij Kitabı), Açık Denizlere Doğru Deniz Kuvvetleri (Prestij Kitabı) ile Hedefteki Donanma (Kırmızı Kedi Yayınları) ve Amatör Denizciler İçin Acil Durum Seyri (Kırmızı Kedi Yayınları) kitaplarının yazarıdır. Aydınlık gazetesinde, “Mavi Vatan” isimli haftalık köşenin yazarıdır. Yurtdışında 2003-2010 yılları arasında başta Karadeniz’de Deniz Güvenliği konusu olmak üzere otuza yakın uluslararası konferansta bildiri sunmuştur. Halen Koç Üniversitesi Denizcilik Forumu Kurucu Direktörü olarak görev yapmaktadır.